<市（鄉）>馬公市 <港口數>19 <港口>馬公、西衛、重光、安宅、烏崁、鎖港、山水、風櫃西、風櫃東、時裡、井垵、五德、鐵線、菜園、石泉、前寮、案山、虎井、桶盤 <市（鄉）>湖西鄉 <港口數>13 <港口>中西、沙港西、沙港中、沙港東、成功、西溪、紅羅、青羅、白坑、南北寮、菓葉、龍門、尖山 <市（鄉）>白沙鄉 <港口數>13 <港口>大倉、講美、城前、鎮海、赤崁、港子、岐頭、後寮、通梁、瓦硐、鳥嶼、員貝、吉貝 <市（鄉）>西嶼鄉 <港口數>12 <港口>小門、合界、橫礁、竹灣、二崁、大菓葉、赤馬、內垵南、內垵北、外垵、池西、大池 <市（鄉）>七美鄉 <港口數>2 <港口>潭子、七美 <市（鄉）>望安鄉 <港口數>8 <港口>潭門、中社、水垵、將軍北、將軍南、花嶼、東嶼坪、東吉 <市（鄉）>